3月10日，2025年ASC世界大學(xué)生超級(jí)計(jì)算機(jī)競(jìng)賽（ASC25）成績(jī)公布，我校計(jì)算機(jī)學(xué)院2022級(jí)本科生夏佳如、張志雄、武良山、龔福星、邱鵬組成的學(xué)生超算團(tuán)隊(duì)（指導(dǎo)老師：林培英）最終排名全球第46名，榮獲二等獎(jiǎng)。

ASC世界大學(xué)生超級(jí)計(jì)算機(jī)競(jìng)賽由中國(guó)發(fā)起組織，是全球最大規(guī)模的大學(xué)生超算競(jìng)賽。大賽推動(dòng)了各國(guó)及地區(qū)間超算青年人才交流和培養(yǎng)，提升了超算應(yīng)用水平和研發(fā)能力。迄今已舉辦12屆，吸引來(lái)自全球上萬(wàn)名大學(xué)生報(bào)名參賽，300余支實(shí)力強(qiáng)隊(duì)參賽。

ASC25賽題涉及HPC系統(tǒng)設(shè)計(jì)、HPL與HPCG基準(zhǔn)測(cè)試優(yōu)化、RNA甲基化修飾位點(diǎn)檢測(cè)和AlphaFold3推理優(yōu)化，全面考察高性能計(jì)算與人工智能融合創(chuàng)新能力。我校超算團(tuán)隊(duì)對(duì)業(yè)界優(yōu)化算法進(jìn)行了系統(tǒng)調(diào)研與深度解析，在超算應(yīng)用分析、性能優(yōu)化等方面展現(xiàn)出超強(qiáng)學(xué)習(xí)能力和實(shí)踐能力。

RNA甲基化修飾位點(diǎn)檢測(cè)賽題要求對(duì)mRNA上的“5-甲基胞嘧啶”（m5C）的修飾位點(diǎn)檢測(cè)流程進(jìn)行性能優(yōu)化。我校超算團(tuán)隊(duì)梳理流程操作步驟、構(gòu)建流程軟件環(huán)境，并完成對(duì)三個(gè)數(shù)據(jù)集約3億4千萬(wàn)條測(cè)序數(shù)據(jù)的處理，通過(guò)一系列并行化方法成功將檢測(cè)工作時(shí)間由6.5小時(shí)縮減到1.5小時(shí)，且精確度與相關(guān)性均維持在95%以上。

AlphaFold3推理優(yōu)化賽題要求對(duì)AlphaFold3的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)代碼進(jìn)行優(yōu)化，并需要將代碼從GPU平臺(tái)移植到CPU平臺(tái)優(yōu)化運(yùn)行。我校超算團(tuán)隊(duì)成功實(shí)現(xiàn)將推理過(guò)程遷移至CPU，并針對(duì)attention模塊，從einsum算子著手優(yōu)化，在確保預(yù)測(cè)精度的前提下，對(duì)組委會(huì)指定的12組蛋白質(zhì)序列實(shí)現(xiàn)高效推理，優(yōu)化了推理使用的XLA內(nèi)核以及并行策略，整體上使AlphaFold3的推理性能平均提升了1.164倍。